Per trovare più spazio e per poter giocare di più, appena maggiorenne passa in prestito dal Genoa al Pescara in Serie B. Nel campionato cadetto Mandragora esplode e mostra tutto il suo talento, tanto che la Juventus mette gli occhi sul centrocampista originario di Napoli e nel gennaio 2016 lo acquista dal Genoa per una cifra di circa 6,5 milioni di euro. Quella stagione, tuttavia, Mandragora la concluderà in Abruzzo. A luglio ecco che si materializza la sua grande opportunità: dalla Serie B con il Pescara alla Serie A con la Juventus. Ma puntuale ecco anche il primo grande ostacolo sul suo cammino, ovvero un grave infortunio al piede destro. La stagione 2016/2017, interamente vissuta alla Juventus, si concluderà con un nulla di fatto. Una sola presenza con la Prima Squadra, lunga appena 4 minuti, il 23 aprile 2017, manco a dirlo, contro il "suo" Genoa.
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